ÚOCHB

Skupina Kvida Stříšovského

Intramembránová proteolýza a biologická regulace
Vědecká skupina
Seniorská
BIO cluster

O naší skupině

Výzkumný program skupiny je zaměřen na biologické membrány a enzymatickou katalýzu v jejich kontextu. Studujeme všudypřítomné intramembránové proteasy z rodiny rhomboidů a mechanistické aspekty jejich funkcí, které jsou relevantní pro biologickou signalizaci, biogenezi membránových proteinů a jejich proteostázi. Při naší práci integrujeme nástroje a přístupy membránové biochemie, enzymologie a strukturní biologie, abychom zjistili jak rhomboidy rozpoznávají své substráty, a uplatňujeme metody kvantitativní proteomiky, buněčné biologie a genetiky, abychom odhalili funkce rhomboidů v organismech. Jsme mezinárodní výzkumná skupina a vítáme motivované studenty a postdoky, kteří by měli zájem s námi pracovat. Neváhejte se ozvat.

Upozornění: EN verze těchto stránek je aktualizována častěji, rozsáhleji a pečlivěji. Koukněte raději tam.

image
Targeting the Membrane-Embedded Rhomboid Protease GlpG: A Multimodal Strategy for Inhibitor Discovery and Mechanistic Insight
Targeting the Membrane-Embedded Rhomboid Protease GlpG: A Multimodal Strategy for Inhibitor Discovery and Mechanistic Insight
Angewandte Chemie International Edition 2026: Early View
Rhomboid proteases, a class of intramembrane proteases characterized by a Ser-His catalytic dyad, have recently emerged as promising therapeutic targets. While inhibitors for soluble serine proteases have been extensively studied, the spectrum of potent rhomboid protease inhibitor chemotypes is limited to active-site targeted nucleophiles. To address this limitation, we conducted a high-throughput screen of over 68,000 compounds targeting the E. coli rhomboid protease GlpG, using a fluorescent liposome-based assay. A selection of 326 inhibitory compounds was evaluated in a subsequent IC50 screen against two variants of GlpG (core domain and full length), a soluble serine protease (chymotrypsin), as well as the human mitochondrial rhomboid PARL. Of these, the selective inhibitory effects of 2 compounds and their analogues on GlpG were confirmed through further biochemical and biophysical characterisation, molecular docking, and solid-state NMR spectroscopy. This study paves the way for…
Extensive targeting of chemical space at the prime side of ketoamide inhibitors of rhomboid proteases by branched substituents empowers their selectivity and potency
European Journal of Medicinal Chemistry 275: 116606 (2024)
Maintenance of organellar protein homeostasis by ER-associated degradation and related mechanisms
Molecular Cell 81 (12): 2507-2519 (2021)
Rhomboid intramembrane protease YqgP licenses bacterial membrane protein quality control as adaptor of FtsH AAA protease
EMBO Journal 39 (10): e102935 (2020)
General and Modular Strategy for Designing Potent, Selective, and Pharmacologically Compliant Inhibitors of Rhomboid Proteases
Cell Chemical Biology 24 (12): 1523-1536 (2017)