Váš webový prohlížeč je zastaralý. Aktualizujte svůj prohlížeč pro větší bezpečnost, rychlost a nejlepší zkušenosti na tomto webu

ÚOCHB

Skupina Kvida Stříšovského

Intramembránová proteolýza a biologická regulace
Vědecká skupina
Seniorská
BIO cluster

O naší skupině

Výzkumný program skupiny je zaměřen na biologické membrány a enzymatickou katalýzu v jejich kontextu. Studujeme všudypřítomné intramembránové proteasy z rodiny rhomboidů a mechanistické aspekty jejich funkcí, které jsou relevantní pro biologickou signalizaci, biogenezi membránových proteinů a jejich proteostázi. Při naší práci integrujeme nástroje a přístupy membránové biochemie, enzymologie a strukturní biologie, abychom zjistili jak rhomboidy rozpoznávají své substráty, a uplatňujeme metody kvantitativní proteomiky, buněčné biologie a genetiky, abychom odhalili funkce rhomboidů v organismech. Jsme mezinárodní výzkumná skupina a vítáme motivované studenty a postdoky, kteří by měli zájem s námi pracovat. Neváhejte se ozvat.

Upozornění: EN verze těchto stránek je aktualizována častěji, rozsáhleji a pečlivěji. Koukněte raději tam.

image
Rhomboid intramembrane protease YqgP licenses bacterial membrane protein quality control as adaptor of FtsH AAA protease
Rhomboid intramembrane protease YqgP licenses bacterial membrane protein quality control as adaptor of FtsH AAA protease
EMBO Journal - (-): Early View (2020).
Magnesium homeostasis is essential for life and depends on magnesium transporters, whose activity and ion selectivity need to be tightly controlled. Rhomboid intramembrane proteases pervade the prokaryotic kingdom, but their functions are largely elusive. Using proteomics, we find that Bacillus subtilis rhomboid protease YqgP interacts with the membrane‐bound ATP‐dependent processive metalloprotease FtsH and cleaves MgtE, the major high‐affinity magnesium transporter in B. subtilis. MgtE cleavage by YqgP is potentiated in conditions of low magnesium and high manganese or zinc, thereby protecting B. subtilis from Mn2+/Zn2+ toxicity. The N‐terminal cytosolic domain of YqgP binds Mn2+ and Zn2+ ions and facilitates MgtE cleavage. Independently of its intrinsic protease activity, YqgP acts as a substrate adaptor for FtsH, a function that is necessary for degradation of MgtE. YqgP thus unites protease and pseudoprotease function, hinting at the evolutionary origin of rhomboid pseudoproteases such as Derlins that are intimately involved in eukaryotic ER‐associated degradation (ERAD). Conceptually, the YqgP‐FtsH system we describe here is analogous to a primordial form of “ERAD” in bacteria and exemplifies an ancestral function of rhomboid‐superfamily proteins.
The Rhomboid Superfamily: Structural Mechanisms and Chemical Biology Opportunities
Trends in Biochemical Sciences 43 (9): 726-739 (2018).
General and Modular Strategy for Designing Potent, Selective, and Pharmacologically Compliant Inhibitors of Rhomboid Proteases
A. Tichá S. Stanchev
K. R. Vinothkumar
D. C. Mikles P. Pachl J. Began J. Škerle K. Švehlová
M. T. N. Nguyen
S. H. L. Verhelst
D. C. Johnson
D. A. Bachovchin
M. Lepšík P. Majer K. Stříšovský
Cell Chemical Biology 24 (12): 1523-1536 (2017).
Quantitative proteomics screen identifies a substrate repertoire of rhomboid protease RHBDL2 in human cells and implicates it in epithelial homeostasis
N. Johnson J. Březinová
E. Stephens
E. Burbridge
M. Freeman
C. Adrain
K. Stříšovský
Scientific Reports 7 : 7283 (2017).
Substrate binding and specificity of rhomboid intramembrane protease revealed by substrate-peptide complex structures
EMBO Journal 33 (20): 2408-2421 (2014).